А небольшая задержка на включение не спасет?
Да вот немного недопонимаю, почему это происходит...
Предполагаю что наступает такой случай, когда девайс уже определил наличие подключенной емкости, и в этот момент щуп отключается, то есть напряжения вроде-как уже и нет (компаратор сработать "не успел"), ну и получается все в порядке, напруги нет, емкость подключена, реле и перекидывается. И в этот момент щуп снова подключается к ЕЩЕ ЗАРЯЖЕННОЙ емкости, обеспечивая благополучную скоропостижную смерть.
Может в детекторе емкость побольше поставить, чтобы "0"появлялся чуть задержанный (на время разряда емкости)
Да, и и при включении можно давать импульс на реле, чтобы оно "туда-сюда" разок перекинулось (типа инициализации), чтобы при включении гарантировать его выключенное состояние. Какую-нибудь RC-цепочку